Маринченко, Лоліта ВікторівнаКукуруза, Євгеній Олександрович2023-10-042023-10-042023Кукуруза, Є. О. Алгоритм пошуку тканиноспецифічних генів, продукти яких секретуються у кров, на прикладі плаценти людини : дипломна робота … бакалавра : 162 Біотехнології та біоінженерія / Кукуруза Євгеній Олександрович. – Київ, 2023. – 78 с.https://ela.kpi.ua/handle/123456789/60879Дипломна робота містить: 78 сторінок, 4 рисунки, 2 таблиці, 1 додаток, 122 посилань на літературні джерела. Об’єкт дослідження: база даних диференційної експресії генів між другим і першим триместрами фізіологічної вагітності. Предмет дослідження: тканиноспецифічні гени, які кодують білки, що секретуються у кров, та їх функціональні зв’язки з іншими генами. Мета роботи: розробка алгоритму пошуку потенційних перспективних біомаркерів прееклампсії на основі даних інтегративного аналізу. Матеріали і методи дослідження: перелік 266 диференційно експресованих генів між другим і першим триместрами фізіологічної вагітності із абсолютним значенням кратності зміни експресії більше 1,0; база даних Human Protein Atlas. Програмне забезпечення Python 3.8.6, бібліотеки openpyxl та requests, модулі re, math та json; база даних STRING. Результати роботи: розроблено алгоритм та програму пошуку генів, які є тканиноспецифічними, і кодують білки, які секретуються у кров, з використанням бази даних Human Protein Atlas. Встановлено шість диференційно експресованих генів, продукти експресіх яких можуть секретуватися у кров та є плацентоспецифічними: CSHL1, EBI3, LIPG, CSH1, F13A1 і FOLR2. Було проаналізовано їх функції, наявність зв’язків з іншими плацентоспецифічними білками. Наукова новизна: вперше запропоновано гени LIPG і FOLR2, як потенційні біомаркери здорового проходження вагітності між другим та першим триместром; удосконалено алгоритм пошуку потенційних біомаркерів впровадженням даних Human Protein Atlas та τ-критерія тканиноспецифічності. Розроблений алгоритм може бути використаний для пошуку потенційних маркерів ускладнень вагітності, пов’язаних з порушенням функцій плаценти, таких як прееклампсія. Встановлені плацентоспецифічні гени можуть бути досліджені далі як потенційні біомаркери.78 с.ukбіомаркералгоритмплацентапрееклампсіясекреціятканиноспецифічністьBachelor Thesis