ДНК-маркери для детекції поліморфізму генів біогенезу продихів EPF1, EPF2 та MUTE пшениці

Скорочена інформація про документ
dc.contributor.authorРимар, Юлія Юріївна
dc.contributor.authorЛахнеко, Ольга Романівна
dc.date.accessioned2026-03-06T13:24:31Z
dc.date.available2026-03-06T13:24:31Z
dc.date.issued2025
dc.description.abstractДНК-маркери є інформативним молекулярним методом для відбору генотипів й значно пришвидшують селекційний процес. Через це розробка молекулярних маркерів є важливим етапом створення селекційних ліній сортів з важливими агрономічними ознаками. Однією з таких ознак є посухостійкість, яка безпосередньо пов'язана із випаровуванням вологи рослиною. Зважаючи на те, що продихова транспірація займає найбільший відсоток від загальних витрат вологи рослиною, в дослідженні особлива увага приділяється генам біогенезу продихів. Метою цієї роботи було розробити ДНК-маркери на виявлення поліморфізму в промоторних і кодуючих послідовностях генів біогенезу продихів EPF1, EPF2 та MUTE й провести скринінг колекції пшениці для пошуку ціннихалелейгенів. В результаті роботи розроблено 12 відтворювальних ДНК-маркерів, а саме 5 ДНК-маркерів на визначення поліморфізму в промоторній області генів EPF1, EPF2 та 7 ДНК-маркерів на визначення поліморфізму в кодуючих ділянках генів EPF1, EPF2 та MUTE. За допомогою розроблених маркерів проведений скринінг вибірки зразків пшениці м'якої міжнародної колекції CIMMYT. У такий спосіб визначено, що найчастіше зустрічалися дві SNP (в позиції -1223 A→G; в позиції -1221 A→C) в промоторній ділянці гена EPF1 з субгеному А серед досліджуваних зразків. Низьку частоту поширення серед вибраних зразків CIMMYT мала описана інсерція в промоторній частині гена EPF1 з субгеному В. Також часто детектувалася серед досліджуваних зразків 4-пн делеція(в позиції -9) гена EPF1-D1, а однонуклеотидний поліморфізм T на G в положенні +274 гена EPF1-A1 мав низьку частоту поширення. Крім того, 297-пн інсерція в промоторі гена EPF2 субгеному В, яка описана для українських сортів, зовсім не виявлена серед міжнародної колекції. Так, створені системи ДНК-маркерів доцільно використовувати як у фундаментальних дослідженнях генетичного різноманіття сортів пшениці,так і в питаннях захисту прав інтелектуальної власності та молекулярної паспортизації.
dc.description.abstractotherDNA markers are an informative molecular method for selecting genotypes and significantly speed up the breeding process. For this reason, the development of molecular markers is an important step in creating breeding lines of varieties with important agronomic traits. One of these traits is drought tolerance, which is directly related to the evaporation of moisture by the plant. In view of this, this study focuses on the genes of stomatal biogenesis, since stomatal transpiration accounts for thelargest percentage of total plant moisture consumption. The aim of this work was to develop DNA markers for detecting polymorphisms in the promoter and coding sequences of the stomatal biogenesis genes EPF1, EPF2, and MUTE and to screen the wheat collection for valuable gene alleles. As a result of the work, 12 reproducible DNA markers were developed, namely 5 DNA markers for detecting polymorphism in the promoter region of EPF1, EPF2 genes and 7 DNA markers for detecting polymorphism in the coding regions ofEPF1, EPF2 and MUTE genes. The developed markers were used to screen a sample of wheat samples from the international collection CIMMYT. Thus, it was determined that two SNPs (at position -1223 A→G; at position -1221 A→C) in the promoter region of the EPF1 gene from subgenome A were most common among the studied samples. The described insertion in the promoter region of the EPF1 gene from subgenome B had a low frequency of distribution among the selected CIMMYT samples. A 4-bp deletion (at position -9) of the EPF1-D1 gene was also frequently detected among the studied samples, and a single nucleotide polymorphism T to G at position +274 of the EPF1-A1 gene had a low frequency of distribution. In addition, the 297-bp insertion in the EPF2 gene promoter of the B subgenome, which was described for Ukrainian varieties, was not found in the international collection at all. Thus, it is advisable to use the developed DNA marker systems both in fundamental studies of wheat geneticdiversity and in the protection of intellectual property rights and molecular certification.
dc.format.pagerangeС. 52-68
dc.identifier.citationРимар, Ю. Ю. ДНК-маркери для детекції поліморфізму генів біогенезу продихів EPF1, EPF2 та MUTE пшениці / Римар Ю. Ю., Лахнеко О. Р. // Біомедична інженерія і технологія. – 2025. – № 18. – С. 52-68. – Бібліогр.: 30 назв.
dc.identifier.doihttps://doi.org/10.20535/.2025.18.333019
dc.identifier.orcid0000-0003-3051-3774
dc.identifier.orcid0000-0002-6460-1724
dc.identifier.urihttps://ela.kpi.ua/handle/123456789/79291
dc.language.isouk
dc.publisherКПІ ім. Ігоря Сікорського
dc.publisher.placeКиїв
dc.relation.ispartofБіомедична інженерія і технологія, № 18, 2025
dc.subjectДНК-маркери
dc.subjectполіморфізм
dc.subjectгени біогенезу продихів EPF1
dc.subjectEPF2
dc.subjectMUTE
dc.subjectпшениця м'яка
dc.subjectDNAmarkers
dc.subjectpolymorphism
dc.subjectstomatabiogenesis genes EPF1
dc.subjectbread wheat
dc.subject.udc575.113:581.821:633.111
dc.titleДНК-маркери для детекції поліморфізму генів біогенезу продихів EPF1, EPF2 та MUTE пшениці
dc.title.alternativeDNA markers for detection of polymorphism in EPF1, EPF2 and MUTE genes of wheat stomata biogenesis
dc.typeArticle

Файли

Контейнер файлів
Зараз показуємо 1 - 1 з 1
Ескіз
Назва:
52-68.pdf
Розмір:
950.23 KB
Формат:
Adobe Portable Document Format
Завантажити
Ліцензійна угода
Зараз показуємо 1 - 1 з 1
Ескіз недоступний
Назва:
license.txt
Розмір:
8.98 KB
Формат:
Item-specific license agreed upon to submission
Опис:
Завантажити

Зібрання

Біомедична інженерія і технологія, Том 3, № 18