Innovative Biosystems and Bioengineering
Постійне посилання на фонд
ISSN 2616-177X (Online)
Періодичність: 4 рази на рік
Рік заснування: 2017
Тематика: оригінальні й оглядові статті та короткі повідомлення з проблем прикладної біології, біомедицини, біотехнології, біоінженерії, біофізики, біоінформатики та хімії живого. Журнал передбачає системний підхід для об’єднання наукової думки фахівців різної спеціалізації, які працюють із науково-технічними розробками в галузі «life sciences»
Офіційний сайт: https://ibb.kpi.ua/
Рік заснування: 2017
Тематика: оригінальні й оглядові статті та короткі повідомлення з проблем прикладної біології, біомедицини, біотехнології, біоінженерії, біофізики, біоінформатики та хімії живого. Журнал передбачає системний підхід для об’єднання наукової думки фахівців різної спеціалізації, які працюють із науково-технічними розробками в галузі «life sciences»
Офіційний сайт: https://ibb.kpi.ua/
Переглянути
Перегляд Innovative Biosystems and Bioengineering за Назва
Зараз показуємо 1 - 20 з 164
Результатів на сторінці
Налаштування сортування
Документ Відкритий доступ A New Algorithm to Analyze the Video Data of Cell Contractions in Microfluidic Platforms(Igor Sikorsky Kyiv Polytechnic Institute, 2018) Nikolov, Nikolay; Visone, Roberta; Nesteruk, Igor; Rasponi, Marco; Redaelly, Alberto; Ніколов, Микола Олександрович; Візоне, Роберта; Нестерук, Ігор Георгійович; Распоні, Марко; Редаеллі, Альберто; Николов, Николай Александрович; Визоне, Роберта; Нестерук, Игорь Георгиевич; Распони, Марко; Редаелли, АльбертоДокумент Відкритий доступ Analysis of Fractional-Order Model of COVID-19 Pandemics With a Nonlinear Incidence Rate(Igor Sikorsky Kyiv Polytechnic Institute, 2020) Varghese, Vinod; Bhoyar, Sonal; Nisar, Kottakkaran SooppyДокумент Відкритий доступ Anode biofilm formation with applied external voltage(Igor Sikorsky Kyiv Polytechnic Institute, 2023) Koltysheva, D. S.; Shchurska, K. O.; Kuzminskyi, Ye. V.Background. The formation of an exoelectrogenic biofilm in a microbial fuel cell (MFC) is an important stage, because it affects later on current generation by the system. The fermented residue after methanogenesis as an inoculum contains not only exoelectrogenic microorganisms, but also methanogens, which reduce the productivity of MFC. The use of current allows the formation of a biofilm enriched with exoelectrogenic microorganisms. Objective. The purpose of our study was to establish the parameters of MFC under periodic application of external voltage. Methods. A two-chamber H-type MFC with a salt bridge between the chambers was used for the study. The anolyte was stirred with a magnetic stirrer for 4 h a day and a 3V voltage was simultaneously applied to create selective conditions for exoelectrogenic biofilm growth. Results. The application of external voltage stimulated the increase in the current and voltage of the MFC. With the periodic application of an external voltage, the MFC current increased to 788 ± 40 mA for the MFC with a resistor and without load. After disconnection and discharge, the MFC current dropped to 189 ± 10 mA for the MFC without load and to 154 ± 8 mA for the MFC with a resistor, respectively. Under the conditions of MFC operation without applying external voltage, the current was 960 ± 50 mA for MFC with an open circuit and 672 ± 35 mA for MFC with a closed circuit when a resistor is connected. For all MFC, the current gradually decreased over time. MFC demonstrated capacitive behaviour: after accumulating charge for 4 h, a discharge from 622 ± 30 mV to 462 ± 23 mV was observed. Microscopy showed fouling of the anode. Since the fermented residue after methanogenesis is mixed consortium, the anodic biofilm was also mixed consortium enriched with different species of exoelectrogens. Conclusions. Periodic application of external voltage allowed to increase the current by 17% and double the voltage compared to MFC without external voltage supply. However, after disconnecting the external voltage source, the MFC gradually discharged, that is, the current and voltage decreased. The maximum value of the current of the MFC with an open circuit was 22% more than the MFC with a closed circuit.Документ Відкритий доступ Antibacterial activity of 1-dodecylpyridinium tetrafluoroborate and its inclusion complex with sulfobutyl ether-B-cyclodextrin against mdr acinetobacter baumannii strains(Igor Sikorsky Kyiv Polytechnic Institute, 2023) Rogalsky, S.; Hodyna, D.; Semenyuta, I.; Frasinyuk, M.; Tarasyuk, O.; Riabov, S.; Kobrina, L.; Tetko, I.; Metelytsia, L.Background.The bacterial pathogen Acinetobacter baumanniiis one of the most dangerous multi-drug-resistant (MDR) microorganisms, which causes numerous bacterial infections. Nowadays, there is an urgent need for new broad-spectrum antibacterial agents with specific molecular mechanisms of action. Long-chain 1-alkylpyridinium salts are efficient cationic biocides which can inhibit enzymes involved in the biosynthesis of bacterial fatty acids.Incorporating these compounds into inclusion complexes with cyclic oligosaccharide B-cyclodextrin can reduce their relatively high acute toxicity.Objective. The aim of this research was to develop new anti-A.baumanniiagents based on hydrophobic 1-alkylpyridinium salt and its inclusion complex with sulfobutyl ether B-cyclodextrin (SBECD). Methods. Hydrophobiccationic biocide 1-dodecylpyridinium tetrafluoroborate (PyrC12-BF4) and its inclu-sion complex with SBECD have been synthesized. The structure of the SBECD/PyrC12-BF4complex was characterized by 1H Nuclear Magnetic Resonance spectroscopy, as well as UV spectroscopy. In vitroanti-bacterial activity of the synthesized compounds was estimated against MDR clinical isolates of A. baumanniiusing standard disc diffusion method. Acute toxicity studies were performed on Daphnia magnamodel hydro-biont.Molecular docking was performed using the crystal structure of the A.baumannii3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase(FabG).Документ Відкритий доступ Antimicrobial activity of composite preparations based on biosurfactants and heterocyclic amino-containing 1,4-naphtoquinone derivatives(Igor Sikorsky Kyiv Polytechnic Institute, 2024) Polish, N. V.; Marintsova, N. G.; Zhurakhivska, L. R.; Komarovska-Porokhnyavets, O. Z.; Lubenets, V. I.; Pokynbroda, T. Ya.; Karpenko, О. V.Проблематика. Розроблення високоефективних та екологічно безпечних композиційних препаратів з антимікробною активністю є актуальною проблемою біотехнології та фармації. Мета. Визначення антимікробної активності нових композиційних препаратів на основі рамноліпідів із гетероциклічними аміно- вмісними похідними 1,4-нафтохінону щодо тест-бактерій Escherichia coli B-906, Staphylococcus aureus 209-P, Mycobacterium luteum B-917 і грибів Candida tenuis UCM Y-70, Aspergillus niger UCM F-1119. Методика реалізації. Дослідження in vitro антимікробної дії гетероциклічних аміновмісних похідних 1,4-нафтохінону, біосурфак- тантів і композиційних препаратів на їх основі щодо культур бактерій Escherichia coli B-906, Staphylococcus aureus 209-P, Mycobacterium luteum B-917 і грибів Candida tenuis UCM Y-70, Aspergillus niger UCM F-1119 шляхом дифузії речовини в агар на твердому живильному середовищі та методом серійних розведень. Прогнозування токсичності гетероциклічних аміновмісних похідних 1,4-нафтохінону з використанням методології in silico за допомогою програмного забезпечення ProTox-II. Результати. Встановлено, що 2-хлоро-3-((1-метил-1H-піразол-3-іл)аміно)нафтален-1,4-діон 3.2 та 2-хлоро-3-((3-(п-толіл)-1Н- піразол-5-іл) аміно) нафтален-1,4-діон 3.3 виявляють антимікробну активність щодо тестових мікроорганізмів, а в їх композицій- них препаратах із рамноліпідами-біосурфактантами антимікробна дія підсилюється. За результатами розрахункової оцінки cпрогнозовано, що досліджені гетероциклічні аміновмісні похідні 1,4-нафтохінону можна віднести до IV класу токсичності. Висновки. Визначено, що антимікробна активність композиційних препаратів 2-хлоро-3-((1-метил-1H-піразол-3-іл)аміно)нафта- лен1,4-діону 3.2 та 2-хлор-3-(3-(3-(р-толіл)-1H-піразол-5-іл)аміно)нафталін-1,4-діону 3.3 із рамноліпідами підвищилась порівняно із синтезованими препаратами.Документ Відкритий доступ Antimicrobial Activity of Fomitopsis Officinalis (Vill.) Bondartsev & Singer in Pure Culture(Igor Sikorsky Kyiv Polytechnic Institute, 2021) Mykchaylova, O. B.; Poyedіnok, N. L.Документ Відкритий доступ Antimicrobial and cytotoxic characteristics of antibiotic streptofungin(Igor Sikorsky Kyiv Polytechnic Institute, 2023) Klochko, V. V.; Todosiichuk, T. S.; Kobzysta, O. P.; Bobyr, V. V.Background. Streptomycetes were and remain a source of new antimicrobial compounds of various nature. A new wave of interest in such research is associated with the possibilities of applied genomics to reveal the hidden biosynthetic potential of streptomycetes, and therefore the discovery of new practically valuable antimicrobial products. The problem of antibiotic resistance of pathogens can be solved by creating compositions of active substances of different nature to overcome the protective mechanisms of pathogens. Objective. The purpose of the work was to establish and evaluate the antimicrobial and cytotoxic characteristics of the new antibiotic streptofungin, synthesized by Streptomyces albus 2435 (CMIM-S-668) and its mutant strains 2435/М, UN44, 4S, US101, AE6, 105, 80/5. Methods. To establish the characteristics of streptofungin, the antagonistic activity of selected S. albus producer strains was determined (by the radial streak method), the minimum inhibitory concentration of the antibiotic (by the serial dilution method), and cytotoxicity was determined by the MTT test with resazurin. Results. The activity of the antibiotic streptofungin against Candida fungi (C. albicans, C. utilis) is shown. Minimum inhibitory concentrations of streptofungin were determined for C. albicans ATCC 10231 (10 μg/ml), B. subtilis ATCC 6633 (200 μg/ml) and P. aeruginosa ATCC 9027 (500 μg/ml). According to the resazurin test, streptofungin does not show a cytotoxic effect in a wide range of concentrations from 2.5 to 500 μg/ml, and therefore can be considered potentially permissible for humans and animals in the studied concentrations. Conclusions. The antagonistic activity of mutant strains of S. albus culture is due to the action of a complex of antimicrobial products that have a different antimicrobial spectrum and mechanism of action. The obtained results give reasons to consider streptofungin as a promising pharmaceutical substance with antifungal action, as well as to consider the possibility of its combination with the bacteriolytic enzyme complex of the same culture for the development of an antimicrobial agent with a wide spectrum of action.Документ Відкритий доступ Arterial Blood Oxygen Saturation and Its Dynamics Due to the Environmental Electromagnetic Conditions(Igor Sikorsky Kyiv Polytechnic Institute, 2018) Mamilov, S. O.; Gorgo, Yu. P.; Yesman, S. S.; Vácziová, M.; Prigancová, A.; Pet'ko, B.Документ Відкритий доступ Aspects of Lyophilization of Cardiac Bioimplant(Igor Sikorsky Kyiv Polytechnic Institute, 2021) Shchotkina, N. V.Документ Відкритий доступ Attenuation of Paraquat-Induced Nephrotoxicity and Dysfunction in Male Wistar Albino Rats(Igor Sikorsky Kyiv Polytechnic Institute, 2020) Ujowundu, C. O.; Anaba, P. I.; Ulinasombu, N. B.; Ujowundu, F. N.; Igwe, K. O.; Ogbuagu, H. D.Документ Відкритий доступ Automated Assessment of a Students Circulatory System Functional State Using Martine's Test(Igor Sikorsky Kyiv Polytechnic Institute, 2018) Voinyk, B. A.; Borisova, G. V.; Umanets, V. S.; Boiko, G. L.; Pavlov, A. V.; Nastenko, Ie. A.Документ Відкритий доступ Bioinformatic Analysis of the Genetic Mechanism of Biomineralization of Biogenic Magnetic Nanoparticles in Bacteria Capable of Tumor-Specific Accumulation(Igor Sikorsky Kyiv Polytechnic Institute, 2022) Gorobets, S.V.; Gorobets, O.Yu.; Kovalova, S.О.Документ Відкритий доступ Biological Evaluation of Medical Devices in the Form of Suppositories for Rectal and Vaginal Use(Igor Sikorsky Kyiv Polytechnic Institute, 2021) Dmytrenko, О. V.; Arkhypova, М. А.; Starosyla, D. B.; Rybalko, S. L.; Gevorkyan, M.; Galkin, A. Yu.Документ Відкритий доступ Biological Risks of Using Non-Thermal Non-Ionizing Electromagnetic Fields(Igor Sikorsky Kyiv Polytechnic Institute, 2020) Nizhelska, O. I.; Marynchenko, L. V.; Piasetskyi, V. I.Документ Відкритий доступ Biomedical Engineering Education: Ukrainian Trajectory Through the Prism of World Experience. Status and Perspectives(Igor Sikorsky Kyiv Polytechnic Institute, 2021) Galkin, Alexander; Галкін, ОлександрДокумент Відкритий доступ Characterization of Placental Mesenchymal Stem Cells Spheroids after Generation, Hypothermic and Subnormothermic Storage(Igor Sikorsky Kyiv Polytechnic Institute, 2019) Prokopiuk, V. Yu.; Hloba, N. S.; Prokopiuk, O. S.; Schedrov, A. O.; Musatova, I. B.Документ Відкритий доступ Current Safety Data of the Complex Herbal Medicine with Sedative and Cardioprotective Actions(Igor Sikorsky Kyiv Polytechnic Institute, 2018) Gorchakova, N.; Heimuller, E.; Galkin, A.Документ Відкритий доступ Designing a multi-epitope vaccine candidate to MERS-CoV: an in silico approach(Igor Sikorsky Kyiv Polytechnic Institute, 2024) Majeed, M. N.; Iqbal, A.; Murtaza, N.; Herrera-Zúñiga, L. D.; Siddique, S.; Raza, M.; Hussain, M.; Sajid, M.Проблематика. Коронавірус Близькосхідного респіраторного синдрому (MERS-CoV), асоційований із важкими респіраторними захворюваннями, походить із регіону Близького Сходу. Вірус передається від тварин до людини, при цьому основним резервуа- рним хазяїном є одногорбий верблюд. Високий рівень смертності від вірусу спонукав до розроблення вакцин і терапевтичних засобів. Мета. Із застосуванням in silico підходу розробити потенційну вакцину проти MERS-CoV, зосереджуючись на білку M як антигені. Методика реалізації. Послідовність білка M у форматі FASTA використовувалася для прогнозування епітопів B-клітин і епітопів головного комплексу гістосумісності I і II класу. З цих передбачуваних епітопів були обрані найкращі. До складу вакцини- кандидата входять епітопи, лінкери та мітки. Послідовність конструкції вакцини-кандидата, що складається з 390 амінокислот, було зворотно транскрибовано, оптимізовано і вставлено в плазміду з метою клонування та експресії за допомогою SnapGene. Innov Biosyst Bioeng, 2024, vol. 8, no. 3 17 Тривимірну структуру вакцини-кандидата було доковано з рецептором TLR-4. Моделювання молекулярної динаміки докованого комплексу було виконано за допомогою GROMACS gmx, версія 2021.4. Результати. За допомогою комп’ютерного моделювання й аналізу розроблено нову вакцину-кандидата із перспективними структурними та функціональними властивостями. Наші результати свідчать про те, що розроблена вакцина-кандидат має потенціал викликати сильну імунну відповідь. Висновки. Застосований in silico підхід пропонує до розгляду перспективну вакцину-кандидата проти MERS-CoV, яка здатна викликати як гуморальну, так і клітинну імунну відповідь. Цей кандидат має потенціал забезпечити захист широкого спектру від MERS-CoV.Документ Відкритий доступ Development of a New Method for Obtaining the Bioplastics Based on Microbial Biopolymers and Lignin(Igor Sikorsky Kyiv Polytechnic Institute, 2022) Yurchenko, A.V.; Golub, N.B.; Jinping, L.Документ Відкритий доступ Early Experimental Results of Nerve Gap Bridging with Silicon Microwires(Igor Sikorsky Kyiv Polytechnic Institute, 2019) Likhodiievskyi, V. V.