Машинне навчання для діагностики захворювань за даними секвенування мікробіому кишківника людини
Вантажиться...
Дата
2023
Науковий керівник
Назва журналу
Номер ISSN
Назва тому
Видавець
КПІ ім. Ігоря Сікорського
Анотація
Дана дипломна робота сфокусована на аналізі даних секвенування ДНК мікробіому кишківника людини. Аналіз був реалізований за допомогою методів машинного навчання, його результати можна використовувати мікробіологам для діагностики захворювань кишківника людини.
У першому розділі було розглянуто поняття секвенування ДНК та методи, які використовуються для цього. Також було розглянуто поняття мікробіому та його зв’язок зі здоров’ям людини.
Другий розділ містить опис роботи з секвенованими даними. Показано вид сигналів, які передаються під час секвенування та подальшу обробку даних перед їх аналізом. Також було описано як проводиться аналіз даних секвенування ДНК мікробіому.
У третьому розділі міститься розробка скрипту для аналізу, яка була виконана за допомогою мови програмування Python, використовуючи методи машинного навчання (бібліотека scikit-learn).
Також було розроблено веб-інтерфейс, який містить навчені моделі, які показали найефективніші результати під час дослідження. Даним інтерфейсом можуть користуватись мікробіологи для діагностики таких захворювань як: хвороба Крона, діабет другого типу та синдром подразненого кишечника.
Точність проведеного аналізу залежить від даних, які будуть використовуватись для діагностування. Для аналізу трьох-класового пакету даних точність досліджень 80-90%. Для аналізу чотирьох-класового пакету даних – 75%.
Опис
Ключові слова
машинне навчання, секвенування мікробіому
Бібліографічний опис
Кузьмінська, Д. В. Машинне навчання для діагностики захворювань за даними секвенування мікробіому кишківника людини : дипломна робота … бакалавра : 153 Мікро- та наносистемна техніка / Кузьмінська Дарія Вячеславівна. – Київ, 2023. – 69 с.