Designing a multi-epitope vaccine candidate to MERS-CoV: an in silico approach
Вантажиться...
Файли
Дата
2024
Науковий керівник
Назва журналу
Номер ISSN
Назва тому
Видавець
Igor Sikorsky Kyiv Polytechnic Institute
Анотація
Проблематика. Коронавірус Близькосхідного респіраторного синдрому (MERS-CoV), асоційований із важкими респіраторними
захворюваннями, походить із регіону Близького Сходу. Вірус передається від тварин до людини, при цьому основним резервуа-
рним хазяїном є одногорбий верблюд. Високий рівень смертності від вірусу спонукав до розроблення вакцин і терапевтичних
засобів.
Мета. Із застосуванням in silico підходу розробити потенційну вакцину проти MERS-CoV, зосереджуючись на білку M як антигені.
Методика реалізації. Послідовність білка M у форматі FASTA використовувалася для прогнозування епітопів B-клітин і епітопів
головного комплексу гістосумісності I і II класу. З цих передбачуваних епітопів були обрані найкращі. До складу вакцини-
кандидата входять епітопи, лінкери та мітки. Послідовність конструкції вакцини-кандидата, що складається з 390 амінокислот,
було зворотно транскрибовано, оптимізовано і вставлено в плазміду з метою клонування та експресії за допомогою SnapGene.
Innov Biosyst Bioeng, 2024, vol. 8, no. 3 17
Тривимірну структуру вакцини-кандидата було доковано з рецептором TLR-4. Моделювання молекулярної динаміки докованого
комплексу було виконано за допомогою GROMACS gmx, версія 2021.4.
Результати. За допомогою комп’ютерного моделювання й аналізу розроблено нову вакцину-кандидата із перспективними
структурними та функціональними властивостями. Наші результати свідчать про те, що розроблена вакцина-кандидат має
потенціал викликати сильну імунну відповідь.
Висновки. Застосований in silico підхід пропонує до розгляду перспективну вакцину-кандидата проти MERS-CoV, яка здатна
викликати як гуморальну, так і клітинну імунну відповідь. Цей кандидат має потенціал забезпечити захист широкого спектру від
MERS-CoV.
Опис
Ключові слова
Бібліографічний опис
Designing a multi-epitope vaccine candidate to MERS-CoV: an in silico approach / M. N. Majeed, A. Iqbal, N. Murtaza, L. D. Herrera-Zúñiga, S. Siddique, M. Raza, M. Hussain, M. Sajid // Innovative Biosystems and Bioengineering : international scientific journal. – 2024. – Vol. 8, No. 3. – P. 3-17. – Bibliogr.: 39 ref.