Нанопорове секвенування ДНК для виявлення генетичних змін
Вантажиться...
Дата
2020
Автори
Науковий керівник
Назва журналу
Номер ISSN
Назва тому
Видавець
КПІ ім. Ігоря Сікорського
Анотація
Об’єктом розгляду є послідовність нуклеотидів молекули ДНК. Предметом дослідження є застосування методів моделювання та аналізу сигналів отриманих шляхом нанопорового секвенування.
Метою роботи є виявлення генетичних змін в послідовності, очищення сигналів від шумів, класифікація сигналів нанопорового секвенування.
В першому розділі наведено огляд літератури стосовно ДНК і мутацій: чому вони стаються, як їх виявляють і класифікують. В другому розділі інформація про нанопорове секвенування: процес секвенування, типи пор, які застосовуються, варіанти нанпорового секвенування та протоколи. В третьому розділі наведено методи вимірювання потенціалу на мембрані, наприклад, метод петч –кламп, де фіксується напруга і реєструється зміна іонного струму. Наведено приклад аналізу сигналів, а саме кореляційний аналіз, з метою знаходження однакових фрагментів послідовності ДНК. В четвертому розділі представлено моделювання сигналів різних класів (послідовність в нормі і з мутацією), методи фільтрації для усунення шумів сигналу та класифікація послідовностей методом К – найближчих сусідів.
Опис
Ключові слова
ДНК, нанопорове секвенування, методи моделювання та аналізу сигналів, DNA, nanopore seqence, methods of modeling and analysis of signals
Бібліографічний опис
Євдощенко, І. М. Нанопорове секвенування ДНК для виявлення генетичних змін : дипломна робота ... бакалавра : 153 Мікро- та наносистемна техніка / Євдощенко Ірина Миколаївна. – Київ, 2020. – 82 с.