Нанопорове секвенування ДНК для виявлення генетичних змін

Скорочена інформація про документ
dc.contributor.advisorІванько, Катерина Олегівна
dc.contributor.authorЄвдощенко, Ірина Миколаївна
dc.date.accessioned2021-03-17T12:14:50Z
dc.date.available2021-03-17T12:14:50Z
dc.date.issued2020
dc.description.abstractenThe object of consideration is the nucleotide sequence of the DNA molecule. The subject of the research is the application of methods of modeling and analysis of signals obtained by nanoporous sequencing. The purpose of the work is to identify genetic changes in the sequence, purification of signals from noise, their classification. The first section reviews the literature on DNA and mutations: why they occur, how they are detected and classified. The second section provides information on nanoporous sequencing: the sequencing process, the types of pores used, nanoporous sequencing options, and protocols. The third section presents methods for measuring the potential on the membrane, for example, for our work it is the method of patch-clamps, where the voltage is fixed and the change in ionic current is registered. An example of signal analysis, namely correlation analysis, in order to find the same fragments of the DNA sequence. The fourth section presents the modeling of signals of different classes (normal and mutated sequence), filtering methods to eliminate signal noise and classification of sequences by the method of K - nearest neighbors.uk
dc.description.abstractukОб’єктом розгляду є послідовність нуклеотидів молекули ДНК. Предметом дослідження є застосування методів моделювання та аналізу сигналів отриманих шляхом нанопорового секвенування. Метою роботи є виявлення генетичних змін в послідовності, очищення сигналів від шумів, класифікація сигналів нанопорового секвенування. В першому розділі наведено огляд літератури стосовно ДНК і мутацій: чому вони стаються, як їх виявляють і класифікують. В другому розділі інформація про нанопорове секвенування: процес секвенування, типи пор, які застосовуються, варіанти нанпорового секвенування та протоколи. В третьому розділі наведено методи вимірювання потенціалу на мембрані, наприклад, метод петч –кламп, де фіксується напруга і реєструється зміна іонного струму. Наведено приклад аналізу сигналів, а саме кореляційний аналіз, з метою знаходження однакових фрагментів послідовності ДНК. В четвертому розділі представлено моделювання сигналів різних класів (послідовність в нормі і з мутацією), методи фільтрації для усунення шумів сигналу та класифікація послідовностей методом К – найближчих сусідів.uk
dc.format.page82 с.uk
dc.identifier.citationЄвдощенко, І. М. Нанопорове секвенування ДНК для виявлення генетичних змін : дипломна робота ... бакалавра : 153 Мікро- та наносистемна техніка / Євдощенко Ірина Миколаївна. – Київ, 2020. – 82 с.uk
dc.identifier.urihttps://ela.kpi.ua/handle/123456789/40067
dc.language.isoukuk
dc.publisherКПІ ім. Ігоря Сікорськогоuk
dc.publisher.placeКиївuk
dc.subjectДНКuk
dc.subjectнанопорове секвенуванняuk
dc.subjectметоди моделювання та аналізу сигналівuk
dc.subjectDNAuk
dc.subjectnanopore seqenceuk
dc.subjectmethods of modeling and analysis of signalsuk
dc.titleНанопорове секвенування ДНК для виявлення генетичних змінuk
dc.typeBachelor Thesisuk

Файли

Контейнер файлів
Зараз показуємо 1 - 1 з 1
Ескіз
Назва:
Yevdoshchenko_bakalavr.pdf
Розмір:
3.25 MB
Формат:
Adobe Portable Document Format
Опис:
Завантажити

Зібрання

Бакалаврські роботи (ЕІ)
Бакалаврські роботи