Порівняльний аналіз диференційної експресії генів плаценти між триместрами фізіологічної вагітності

Скорочена інформація про документ
dc.contributor.advisorМаринченко, Лоліта Вікторівна
dc.contributor.authorЛевченко, Станіслав Олександрович
dc.date.accessioned2025-08-26T12:18:06Z
dc.date.available2025-08-26T12:18:06Z
dc.date.issued2025
dc.description.abstractДипломна робота містить 130 сторінок, 1 таблиця, 15 рисунків, 183 джерела. Мета роботи: здійснити порівняльний та розвідувальний аналіз диференційної експресії генів плаценти між триместрами фізіологічної вагітності для виявлення молекулярних механізмів розвитку плаценти та потенційних біомаркерів прееклампсії. Об’єкт дослідження: інтегрований масив мікрочіпових даних експресії генів плаценти людини (77 зразків із репозитарію GEO), що охоплює I, II та III триместри фізіологічної вагітності. Предмет дослідження: диференційна експресія генів у плаценті людини між першим-другим і другим-третім триместрами фізіологічної вагітності. Матеріали і методи дослідження: попередньо оброблені дані експресії генів плаценти, отримані за технологією мікрочіпів, R-пакети для візуалізації (ggplot2, smoothScatter тощо) та бібліотеки для аналізу збагачення шляхів (ReactomePA, KEGGREST). Результати роботи: У процесі дослідження фізіологічної вагітності виявлено 323 диференційно експресовані гени між I та II триместрами –та 617 генів між II та III триместрами. Візуалізовано ключові сигнальні шляхи, в яких беруть участь потенційні біомаркери: PAEP, ALPP та CRH, що відображає їхню роль у регуляції проліферації та диференціації трофобластів (через PI3K–Akt та TGF-B) та стимуляції ангіогенезу й адаптації плаценти до гіпоксії (через HIF-1 та VEGF). Наукова новизна: в результаті багаторівневого біоінформатичного функціонального аналізу було підтверджено ідентифікацію 20 генів із найбільш значущими змінами експресії між першим і другим та другим і третім триместрами фізіологічної вагітності та візуалізовано ключові сигнальні шляхи, такі як TGF beta, Wnt, PI3K-Akt, JAK, STAT, в яких ці потенційні біомаркери прееклампсії беруть участь; поглиблено уявлення про молекулярні механізми розвитку плаценти для виявлення потенційних біомаркерів прееклампсії.
dc.description.abstractotherThis bachelor’s thesis comprises 130 pages, 1 table, 15 figures, and 183 references. Objective: To perform a comparative and exploratory analysis of differential gene expression in the human placenta across the first, second, and third trimesters of normal pregnancy, aiming to elucidate the molecular mechanisms of placental development and identify potential biomarkers of preeclampsia. Research Object: An integrated microarray dataset of human placental gene expression (77 samples from the GEO repository), covering the I, II, and III trimesters of physiological pregnancy. Research Subject: Differential gene expression in the human placenta between the first and second trimesters, and between the second and third trimesters of physiological pregnancy. Materials and Methods: Pre-processed placental gene expression data obtained via microarray technology; R packages for visualization (ggplot2, smoothScatter, etc.); and libraries for pathway enrichment analysis (ReactomePA, KEGGREST). Results: A total of 323 differentially expressed genes were identified between the first and second trimesters, and 617 between the second and third trimesters. Key signaling pathways involving potential biomarkers – PAEP, ALPP, and CRH – were visualized, highlighting their roles in trophoblast proliferation and differentiation (via PI3K–Akt and TGF-β pathways) and in angiogenesis and placental adaptation to hypoxia (via HIF-1 and VEGF pathways). Novelty: Through a multilevel bioinformatic functional analysis, we confirmed the identification of 20 genes with the most significant expression changes between the first second and second–third trimesters of physiological pregnancy and visualized key signaling pathways –TGF-B, Wnt, PI3K –Akt, JAK, and STAT – in which these potential preeclampsia biomarkers participate, thereby deepening our understanding of the molecular mechanisms underlying placental development and potential preeclampsia biomarkers.
dc.format.extent130 с.
dc.identifier.citationЛевченко, С. О. Порівняльний аналіз диференційної експресії генів плаценти між триместрами фізіологічної вагітності : дипломна робота … бакалавра : 162 Біотехнології та біоінженерія / Левченко Станіслав Олександрович. — Київ, 2024. — 130 с.
dc.identifier.urihttps://ela.kpi.ua/handle/123456789/75674
dc.language.isouk
dc.publisherКПІ ім. Ігоря Сікорського
dc.publisher.placeКиїв
dc.subjectплацента
dc.subjectдиференційна експресія генів
dc.subjectмікрочіпи
dc.subjectвулканічний графік
dc.subjectMA-графік
dc.subjectпрееклампсія
dc.subjectplacenta
dc.subjectdifferential gene expression
dc.subjectmicroarrays
dc.subjectvolcano plot
dc.subjectMA plot
dc.subjectpreeclampsia
dc.titleПорівняльний аналіз диференційної експресії генів плаценти між триместрами фізіологічної вагітності
dc.title.alternativeTrimester-based comparison of differential gene expression in the human placenta during physiological pregnancy
dc.typeBachelor Thesis

Файли

Контейнер файлів
Зараз показуємо 1 - 1 з 1
Ескіз
Назва:
Levchenko_bakalavr.pdf
Розмір:
2.35 MB
Формат:
Adobe Portable Document Format
Завантажити
Ліцензійна угода
Зараз показуємо 1 - 1 з 1
Ескіз недоступний
Назва:
license.txt
Розмір:
8.98 KB
Формат:
Item-specific license agreed upon to submission
Опис:
Завантажити

Зібрання

Бакалаврські роботи (КББЕ)
Бакалаврські роботи