Комп'ютерне моделювання структури РНК-залежної РНК-полімерази DENV-NS5

Скорочена інформація про документ
dc.contributor.advisorДем'яненко, Ірина Володимирівна
dc.contributor.authorБанзалов, Андрій Юрійович
dc.date.accessioned2025-08-26T09:57:53Z
dc.date.available2025-08-26T09:57:53Z
dc.date.issued2025
dc.description.abstractДипломна робота містить 56 сторінок, 7 таблиць, 1 діаграму, 8 рисунків, 32 використаних джерел. Дипломна робота присвячена оновленню тривимірної структури білка DENV-NS5. Це є актуальною проблемою так, як сучасні дослідження вказують на те, що експериментальні методи такі як кристалізація і рентгеноструктурний аналіз погано репрезентують конформацію DEVN-NS5 і для повного розуміння трьох вимірної структури білка в природніх умовах, необхідно застосовувати комп'ютерне моделювання. Метою даної роботи є створення комп’ютерної моделі РНК-залежної РНК полімерази NS5 вірусу денге, її верифікація та порівняння з вже існуючою моделлю. Об’єктом дослідження є РНК-залежна РНК-полімераза білка NS5 вірусу денге. Предметом дослідження є структурна організація RdRp-білка NS5, його гнучкість у природних умовах, взаємодія з іонами металів (Zn2+, Mg2+) та кофактором S-аденозилметіоніном (SAM). У результаті виконання роботи було створено комп’ютерну тривимірну модель білка DENV-NS5, яку можна використовувати в розробці нових вакцин для лікування вірусу денге.
dc.description.abstractotherThe diploma thesis comprises 56 pages, 7 tables, 1 diagram, 8 figures, and 32 references. This diploma thesis is devoted to updating the three-dimensional structure of the DENV-NS5 protein. This is an urgent problem, as current research indicates that experimental methods such as crystallization and X-ray crystallography is poorly represent the conformation of DEVN-NS5 and computer modeling is necessary to fully understand the three-dimensional structure of the protein in vivo. The objective of this study is to create a computer model of the RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) NS5 of the dengue virus, verify it, and compare it with an existing model. The object of the study is the RNA-dependent RNA polymerase of the NS5 protein of the dengue virus. The subject of the study is the structural organization of the NS5 RdRp protein, its flexibility under natural conditions, interaction with metal ions (Zn2+, Mg2+), and the cofactor S-adenosylmethionine (SAM). The first chapter of the thesis is dedicated to a literature review concerning the dengue virus and its non-structural protein 5. The second chapter presents the materials and methods used in the research. The third chapter contains the results of the computer modeling of the studied structure and its comparison with the experimental model. As a result of the work, a computer-generated three-dimensional model of the DENV-NS5 protein was created, which can be used in the development of new vaccines for dengue virus treatment.
dc.format.extent56 с.
dc.identifier.citationБанзалов, А. Ю. Комп'ютерне моделювання структури РНК-залежної РНК-полімерази DENV-NS5 : дипломна робота … бакалавра : 162 Біотехнології та біоінженерія / Банзалов Андрій Юрійович. — Київ, 2025. — 56 с.
dc.identifier.urihttps://ela.kpi.ua/handle/123456789/75671
dc.language.isouk
dc.publisherКПІ ім. Ігоря Сікорського
dc.publisher.placeКиїв
dc.subjectвірус денге
dc.subjectDENV-NS5
dc.subjectкомп'ютерне моделювання
dc.subjectтривимірні структури білків
dc.subjectdengue virus
dc.subjectcomputer modeling
dc.subjectthree-dimensional protein structures
dc.titleКомп'ютерне моделювання структури РНК-залежної РНК-полімерази DENV-NS5
dc.title.alternativeComputer modeling of the structure of the RNA-dependent RNA polymerase DENV-NS5
dc.typeBachelor Thesis

Файли

Контейнер файлів
Зараз показуємо 1 - 1 з 1
Ескіз
Назва:
Banzalov_bakalavr.pdf
Розмір:
1.22 MB
Формат:
Adobe Portable Document Format
Завантажити
Ліцензійна угода
Зараз показуємо 1 - 1 з 1
Ескіз недоступний
Назва:
license.txt
Розмір:
8.98 KB
Формат:
Item-specific license agreed upon to submission
Опис:
Завантажити

Зібрання

Бакалаврські роботи (КББЕ)
Бакалаврські роботи