Біоінформатичний аналіз білків біомінералізації біогенних магнітних наночастинок у пробіотиків

dc.contributor.advisorГоробець, Світлана Василівна
dc.contributor.authorМізюрко, Лілія Анатоліївна
dc.date.accessioned2022-07-06T09:30:13Z
dc.date.available2022-07-06T09:30:13Z
dc.date.issued2022-06
dc.description.abstractenThe master's dissertation contains 129 pages, 25 tables, 21 figures, 90 sources used. Biological synthesis of magnetic nanoparticles by living organisms such as plants, higher fungi and microorganisms (fungi, viruses, bacteria and actinomycetes). The nanoparticles obtained by this method are used in the biomedical field, the advantages of this method are its efficiency, environmental friendliness and purity of the process. Probiotic microorganisms capable of biomineralization are ideal for the synthesis of nanoparticles for use in biomedicine, as they are non-pathogenic and easy to cultivate. The study of the biomineralization process in probiotic microorganisms and the study of the functions of biomineralization proteins for further applications are relevant. The aim is to study the proteins of biomineralization of biogenic magnetic nanoparticles in probiotics using comparative genomics methods and to calculate the physicochemical properties of proteins of biomineralization of biogenic magnetic nanoparticles in probiotics using the Biopython package of the python programming language. The tasks are methods of comparative genomics to determine the ability to synthesize biogenic magnetic nanoparticles (BMN) in selected probiotic microorganisms. The object of research is the proteomes of magnetotaxis bacteria and probiotic microorganisms, proteins of biomineralization of biogenic magnetic nanoparticles in probiotic microorganisms. The subject of research is the physicochemical properties of mam-proteins of magnetotaxis bacteria and their homologues in probiotic microorganisms, the genetic mechanism of biomineralization of biogenic magnetic nanoparticles in probiotic microorganisms. The methods of comparative genomics and the Biopython package of the python programming language were used to calculate the physicochemical properties of proteins. The physicochemical properties of biomineralization proteins of biogenic magnetic nanoparticles in selected magnetotaxis bacteria were calculated. For the first time, the physicochemical properties of biomineralization proteins of biogenic magnetic nanoparticles of probiotics were calculated using the Biopython package of the python programming language in selected probiotics. For the first time, it was found that the physicochemical properties of biomineralization proteins of biogenic magnetic nanoparticles of probiotics coincide with the physicochemical properties of homologous proteins of magnetotaxis bacteria. The results were published in the Proceedings of the III International Scientific and Practical Conference and the All-Ukrainian Scientific and Practical Conference of Students, Postgraduates and Young Scientists "Biotechnology of the XXI Century".uk
dc.description.abstractukМагістерська дисертація містить 129 сторінок, 25 таблиць, 21 рисунок, 90 використаних джерел. Біологічний синтез магнітних наночастинок за допомогою живих організмів, таких як рослини, вищі гриби та мікроорганізми (гриби, віруси, бактерії та актиноміцети). Наночастинки, отримані цим методом використовуються в біомедичній галузі, перевагами цього методу є його ефективність, екологічність та чистота процесу. Пробіотичні мікроорганізми здатні до біомінералізації ідеально підходять для синтезу наночастинок для використання у біомедицині, так як не є патогенними і легкі у культивуванні. Актуальним є дослідження процесу біомінералізації у пробіотичних мікроорганізмів та дослідження функцій білків біомінералізації для подальших застосувань. Метою є дослідити білки біомінералізації біогенних магнітних наночастинок у пробіотиків за допомогою методів порівняльної геноміки і розрахувати фізико-хімічні властивості білків біомінералізації біогенних магнітних наночастинок у пробіотиків з використанням пакету Biopython мови програмування python. Завданнями є методами порівняльної геноміки визначити здатність до синтезу біогенних магнітних наночастинок (БМН) у обраних пробіотичних мікроорганізмів, методами пакету Biopython мови програмування python розрахувати фізико-хімічні властивості гомологів mam-білків магнітотаксисних бактерій у протеомах пробіотичних мікроорганізмів. Об’єкт дослідження є протеоми магнітотаксисних бактерій та пробіотичних мікроорганізмів, білки біомінералізації біогенних магнітних наночастинок у пробіотичних мікроорганізмів. Предмет дослідження – це фізико-хімічні властивості mam-білків магнітотаксисних бактерій та їх гомологів у пробіотичних мікроорганізмів, генетичний механізм біомінералізації біогенних магнітних наночастинок у пробіотичних мікроорганізмів. Було використанно методи порівняльної геноміки і методи пакету Biopython мови програмування python для розрахунку фізико-хімічних властивостей білків. Було розраховано фізико-хімічні властивості білків біомінералізації біогенних магнітних наночастинок у обраних магнітотаксисних бактерій. Вперше розраховано фізико-хімічні властивості білків біомінералізації біогенних магнітних наночастинок пробіотиків з використанням пакету Biopython мови програмування python у обраних пробіотиків. Вперше виявлено, які фізико-хімічні властивості білків біомінералізації біогенних магнітних наночастинок пробіотиків співпадають з фізико-хімічними властивостями гомологічних білків магнітотаксисних бактерій. Результати було опубліковано у Матеріалах ІІІ міжнародної науково-практичної конференції і Всеукраїнської науково-практичної конференції студентів, аспірантів і молодих вчених «Біотехнологія XXI століття».uk
dc.format.page129 с.uk
dc.identifier.citationМізюрко, Л. А. Біоінформатичний аналіз білків біомінералізації біогенних магнітних наночастинок у пробіотиків : магістерська дис. : 162 Біотехнології та біоінженерія / Мізюрко Лілія Анатоліївна. – Київ, 2022. – 129 с.uk
dc.identifier.urihttps://ela.kpi.ua/handle/123456789/48429
dc.language.isoukuk
dc.publisherКПІ ім. Ігоря Сікорськогоuk
dc.publisher.placeКиївuk
dc.subjectбіомінералізаціяuk
dc.subjectмагнітотаксисні бактеріїuk
dc.subjectзелений синтезuk
dc.subjectбіомедицинаuk
dc.subjectадресна доставка ліківuk
dc.subjectнаночастинкиuk
dc.subjectмагнітні наночастинкиuk
dc.subjectпробіотичні бактеріїuk
dc.subjectбіоінформатикаuk
dc.subjectbiomineralizationuk
dc.subjectmagnetotaxis bacteriauk
dc.subjectgreen synthesisuk
dc.subjectbiomedicineuk
dc.subjecttargeted drug deliveryuk
dc.subjectnanoparticlesuk
dc.subjectmagnetic nanoparticlesuk
dc.subjectprobiotic bacteriauk
dc.subjectbioinformaticsuk
dc.subject.udc537.6:537.621uk
dc.titleБіоінформатичний аналіз білків біомінералізації біогенних магнітних наночастинок у пробіотиківuk
dc.typeMaster Thesisuk

Файли

Контейнер файлів
Зараз показуємо 1 - 1 з 1
Вантажиться...
Ескіз
Назва:
Miziurko_magistr.pdf
Розмір:
4.93 MB
Формат:
Adobe Portable Document Format
Опис:
Ліцензійна угода
Зараз показуємо 1 - 1 з 1
Ескіз недоступний
Назва:
license.txt
Розмір:
1.71 KB
Формат:
Item-specific license agreed upon to submission
Опис: