Біоінформатична розробка та валідація системи мультиплексного синтезу бібліотеки генів за допомогою ПЛР
Вантажиться...
Дата
2026-06
Науковий керівник
Назва журналу
Номер ISSN
Назва тому
Видавець
Анотація
Дипломна робота містить 75 сторінок основного тексту, 16 рисунків, 10 таблиць, 3 додатки, 48 джерел літератури. Бібліотеки генетичних конструктів відкривають величезні можливості для вдосконалення генетичних конструктів, розробки персональної медицини, та метаболічної інженерії, але їхній синтез є складним та тривалим завданням. Основними причинами цього є технічні обмеження синтезу олігонуклеотидів, точність послідовностей яких суттєво падає після 300 нт, а також багатостадійність і тривалість збирання генетичних конструктів, що робить побудову бібліотек з 1000 та більше конструктів довжинами від 1000 пн практично недосяжним завданням для багатьох дослідників та інституцій. Рішенням може бути застосування систем мультиплексного синтезу, зокрема технології DropSynth, які дозволяють паралельно синтезувати до 1536 конструктів значно більшої довжини (до 1500 пн), за одну ітерацію, що займає тижні замість місяців. Принцип полягає у поєднанні синтезу олігонуклеотидних наборів (OLS) та емульсійної ПЛР типу подовження та перекриття, що дозволяє використовувати краплі як мікрореактори, в яких окремо збираються повноцінні конструкти. У цій роботі описано весь технологічний процес розробки та відтворення технології DropSynth, проведеного у відділенні розробки біотехнологічних продуктів ТОВ «ЮРіЯ-ФАРМ», з використанням нового підходу до формування крапель на основі системи мікрофлюїдики Fluigent Drop-Seq, яка має високу точність та відтворюваність порівняно з іншими підходами. Результатом роботи є оптимізована суміш для формування крапель, збірка та аналіз двох 5′UTR-конструктів довжиною 700 пн з 3 олігонуклеотидів довжиною 300 нт для кожного конструкту
Опис
Ключові слова
мультиплексний синтез днк, ePCR, DropSynth 2.0, мікрофлюїдика, Fluigent Drop-Seq, ТОВ «ЮРіЯ-ФАРМ»
Бібліографічний опис
Строганов, Олексій Олексійович. Біоінформатична розробка та валідація системи мультиплексного синтезу бібліотеки генів за допомогою ПЛР : дипломна робота ... бакалавра : 162 «Біотехнології та біоінженерія» / Строганов, Олексій Олексійович. – Київ, 2026. – 75 с.