Аналіз диференційно експресованих генів і біологічних процесів у плаценті людини між першим і другим триместром фізіологічної вагітності
Вантажиться...
Дата
2024
Автори
Науковий керівник
Назва журналу
Номер ISSN
Назва тому
Видавець
КПІ ім. Ігоря Сікорського
Анотація
Дипломна робота містить: 177 сторінки, 35 рисунків, 5 таблиць, 2 додатки, 152 посилань на літературні джерела.
Об'єкт дослідження: об’єднані дані експресії генів, що отримані в результаті інтегративного аналізу, у плаценті людини з першого (13 зразків) і другого (9 зразків) триместру нормальної вагітності.
Предмет дослідження: диференційно експресовані гени та їх участь у біологічних процесах.
Мета роботи: виявлення диференційно експресованих генів (ДЕГів) і збагачених біологічних процесів у плаценті людини між першим і другим триместром фізіологічної вагітності.
Матеріали і методи дослідження: матриця з нормалізованими значеннями експресії анотованих генів після видалення батч-ефекту, яка містить профілі експресії генів тринадцяти плацентарних зразків з першого та дев’яти з другого триместрів фізіологічної вагітності. Методи – статистичні та біоінформатичні: програмне середовище R; аналіз диференційно експресованих генів – limma; побудова теплових карт – pheatmap, ComplexHeatmap; метод головних компонент – stats, factorextra; аналіз збагачених наборів генів – clusterProfiler, enrichplot.
Результати роботи: ідентифіковано сім основних функціональних кластерів, що об’єднують 30 найбільш статистично значущих біологічних процесів, гени яких проявляють скоординовану і найбільш виражену зміну експресії у плаценті між першим і другим триместром фізіологічної вагітності.
Наукова новизна: вперше за допомогою аналізу збагачених наборів генів (GSEA) визначено біологічні процеси, гени-учасники яких проявляють скоординовані найбільші зміни експресії у плаценті між першим і другим триместром фізіологічної вагітності.
Опис
Ключові слова
біомаркер, наліз диференційно експресованих генів, аналіз збагачених наборів генів, біологічні процеси, плацента, ускладнення вагітності
Бібліографічний опис
Джікірба, Р. І. Аналіз диференційно експресованих генів і біологічних процесів у плаценті людини між першим і другим триместром фізіологічної вагітності : дипломна робота … бакалавра : 162 Біотехнології та біоінженерія / Джікірба Роман Іванович. – Київ, 2024. – 177 с.