Магістерські роботи (КБ)
Постійне посилання зібрання
Переглянути
Нові надходження
Документ Відкритий доступ Розробка оптимальної моделі потреби виробництва ротавірусних вакцин з розрахунком стадії культивування(КПІ ім. Ігоря Сікорського, 2021-05) Юрченко, Олександра Анатоліївна; Маринченко, Лоліта ВікторівнаДипломна робота містить 76 сторінок, 16 таблиць, 18 рисунків, перелік посилань з 57 найменувань, 2 додатки. Робота присвячена оптимізації стадії культивування антигенів при виробництві ротавірусних вакцин з урахуванням відсотку імунізації населення України, який дозволить стримувати поширення захворювання. На підставі статистичних даних народжуваності за 2000-2020 рр. та захворюваності на ротавірусну інфекцію в Україні за січень 2017 - березень 2021 рр. було проведено передбачення народжуваності та розповсюдження ротавірусної інфекції в Україні з використанням статистичних методів, а саме побудови моделей ARIMA та SARIMAX. Для встановлення необхідної кількості вакцин для населення було розраховано відсоток населення України, що має бути імунізоване для стримання розповсюдження ентериту. Було проведено розрахунки стадії культивування антигенів для виробництва ротавірусних вакцин з урахуванням отриманих даних. Розроблено стартап-проект по створенню програмного забезпечення розрахунку необхідної кількості вакцин для імунізації з урахуванням епідеміологічної ситуації. Результати дослідження дають підстави для подальшої оптимізації стадій виробництва вакцин та створення нових ефективних фармацевтичних виробництв вакцин на території України.Документ Відкритий доступ Біотехнології штучного магнітомічення та природне магнітомічення клітин тварин на прикладі Danio rerio(КПІ ім. Ігоря Сікорського, 2021-05) Лебединська, Юлія Вадимівна; Горобець, Світлана ВасилівнаДипломна робота містить 117 сторінок, 26 таблиць, 41 рисунок, перелік посилань з 47 найменувань. Можливість синтезувати біогенні магнітні наночастинки (БМН) доведена для представників прокаріотів, архей та еукаріотів, в тому числі і тварин. Штучно введені магнітні наночастинки (НЧ) в організмі тварин накопичуються в мозку, серці, печінці, нирках, легенях тощо. Мета даної роботи – дослідження штучного магнітомічення та природного магнітомічення клітин тварин на прикладі Danio rerio. Предмет дослідження: закономірності природного та штучного магнітомічення клітин тварин на прикладі Danio rerio. Об’єкт дослідження: геноми і протеоми магнітотаксисних бактерій (МТБ) Magnetospirillum gryphiswaldense MSR-1; геноми і протеоми рибки Danio rerio; органи рибок Danio rerio. У роботі застосовано такі методи дослідження: методи порівняльної геноміки, метод виявлення заліза у формі окисних сполук – реакція Перлса, метод дослідження магнітофоретичної рухливості, метод отримання магнітних наночастинок, методи статистичного аналізу. У роботі методами порівняльної геноміки було встановлено можливість синтезу Danio rerio БМН. Вперше показано, що накопичення штучних магнітних наночастинок в органах Danio rerio відбувається в тих органах, в яких доведена наявність біогенних магнітних наночастинок, в мозку, серці, печінці та нирках. Показано, що магнітофоретична рухливість кластерів магнітних наночастинок в клітинах мозку, серця, печінки та нирок корелює із кількістю введених штучних магнітних наночастинок.Документ Відкритий доступ Роль WNT-сигналінгу та ауто - і мітофагії у постнатальній диференціації кардіоміоцитів щурів(КПІ ім. Ігоря Сікорського, 2021-05) Лучко, Роман Андрійович; Горго, Юрій ПавловичМагістерська дисертація: 84 сторінки, 24 таблиці,14 рисунків, 4 додатки. Канонічний Wnt-сигналінг, ауто- і мітофагія є важливими детермінантами клітинної долі кардіоміоцитів ссавців у кардіогенезі, гомеостазі та патології. Демографічне старіння, розповсюдження нездорового способу життя та деградація екосфери спричинюють ріст кількості випадків серцевих патологій, які не підлягають конвенційному лікуванню.Розуміння функціонування детермінант клітинної долі у розвитку серцяможе допомогти відкрити як можна відновлювати пошкоджені органи чи попереджатиїх ушкодження. Під час постнатальної диференціації серця змінюєтьсяйого енергетичний метаболізм, розщеплюються перехідні структури і відбувається спеціалізаціяпротеому для механічної стійкості і постійної скоротливої роботи. Аналогічні процеси є необхідними для відновлення серця після ушкоджень, і частково відбуваються у окремих випадках. Канонічний Wntсигналінг, ауто- і мітофагія задіяні у цих перетвореннях, як уже було показано, та їх достеменна роль і взаємозв’язок лишаються невідомими. Предмет дослідження – вплив модуляції канонічного Wnt-сигналінгу на неонатальні КМЦ щура в культурі та взаємодія канонічного Wnt-сигналінгу і компонентів ауто- і мітофагії. Об’єкт дослідження – культура неонатальних КМЦ щурів породи Wistar, доступні в публічних БД дані стосовно молекулярних елементів Wntенхансеосоми, їх мотиви, а також послідовності генів задіяних у ауто- і мітофагії в КМЦ atg5, atg7та becn1. Вперше було ідентифіковано потенційні WREу послідовностях генів atg5та atg7, показано що модуляція канонічного Wnt-сигналінгу покращує виживаність неонатальних КМЦ в культурі і пригнічує їх диференціацію.Документ Відкритий доступ Сорбція пробіотичних культур ентеросорбентами на основі високодисперсного кремнезему(КПІ ім. Ігоря Сікорського, 2019-12) Каташов, Степан Олександрович; Маринченко, Лоліта ВікторівнаМагістерська дисертація: с., 22 рис., 17 табл., 81 посилання. Важливим фактором ефективності пробіотикотерапії є виживаність клітин у шлунково-кишковому тракті та їх інтеграція в біоплівку кишечника. Тому набуло актуальності створення комбінованих препаратів з іммобілізованими культурами. Метою цієї роботи було дослідження впливу сорбції пробіотичних культур на гідро- та ксерогелі препарату «Ентеросгель» та на препараті «Силлард П». Об’єкт досліджень: комплекс сорбент-пробіотик. Предмет досліджень: виживаність пробіотичних культур після сорбції на ентеросорбентах на основі високодисперсного кремнезему. Методи досліджень: мікробіологічні. Показано та візуалізовано сорбцію пробіотичних культур на гідро- та ксерогелі препарату «Ентеросгель» та на препараті «Силлард П»; спостерігали кращу сорбцію культури на вологому препараті, що пояснюється гідрофобністю сухого препарату. Визначено, що іммобілізація на ентеросгелі спричиняла меншу загибель клітин, ніж на високодисперсному сухому порошку Силлард П. Встановлено, що виживаність іммобілізованих і не іммобілізованих зразків Lactobacillus plantarum після зберігання в протягом 30 діб у холодильнику за температури +4 оС зменшилась на 22 - 32 %. Ліофільне висушування призводило до зменшення виживаності на 2 порядки. Визначено раціональні співвідношення «сорбент-суспендована культура» після сорбції: від 0,1 г/см3 до 0,15 г/см3 суспензії культури для сухого та для вологого ентеросгелю. Встановлено позитивний вплив додавання висушеної бактеріальної целюлози на виживаність клітин, сорбованих та несорбованих на ентеросгелі, на 20-30 %, що потребує подальших досліджень. Розроблено стартап-проект препарату «Ентероплантарум».Документ Відкритий доступ Особливості алгоритму розрахунку кривих для опису та передбачення чутливості культур ракових клітинних ліній до хіміотерапії(КПІ ім. Ігоря Сікорського, 2020-05) Ємельяновський, Микита Ігорович; Шевгалішин, Роман ЛьвовичМагістерська дисертація складається з пояснювальної записки формату А4. Пояснювальна записка містить 106 сторінок, 8 таблиць, 10 рисунків, 40 посилань. Об'єктом дослідження є вихідні показники CV з ракових клітинних ліній та їх реакції на терапію. Метою дослідження є оцінка характеру вихідних даних, аналіз роботи існуючого програмного алгоритму та формулювання технічного завдання модифікації вихідного коду програми для покращення її роботи. Методи, використані в даному дослідженні, включали аналіз вихідних експериментальних даних CV, обчислення біостатистичних показників, in silico моделювання клітинних реакцій на хіміотерапевтичні препарати, визначення математичних аспектів алгоритму генерації логістичних кривих тощо. Магістерську дисертацію було складено на основі літературного огляду науково-технічної літератури та невиданих матеріалів за темою дисертації, обміну ідеями під час проходження переддипломної практики, та проведення власних досліджень in silico. Моделювання, розрахунки та дослідження літератури проводилися на локальному комп’ютері. Результатом дослідження є опис неочікуваних реакцій ракових клітинних ліній на терапію, що поточна версія алгоритму оболбляє помилково. Було детально вивчено принцип роботи програми розрахунку регресії, вказано на можливі проблеми в її роботі, складено стартап-проект, зроблено висновки. Прийняття описаних змін до даного програмного пакету може підвищити точність оцінки даних за змінами життєздатностей клітинних ліній. Це може позитивно вплинути на якість розроблюваних видів протиракових терапій, особливо тих, в яких використовується більше одного виду ліків.Документ Відкритий доступ Синтез та властивості магніточутливих нанокомпозитів на основі гемцитабіну для застосування в онкотерапії(КПІ ім. Ігоря Сікорського, 2020-05) Тарасюк, Богдан Ігорович; Горбик, Петро ПетровичМагістреська десертація: 83 сторінки, 17 рисунків, 24 таблиці, 61 джерело. Магістерська дисертація присвячена актуальному нині питанню – використанню нанокон’югатів на основі наночастинок магнетиту та гемцитабіну як спосіб реалізації механізму адресної доставки лікарського засобу. Зокрема, розглянуто проблему підвищення біоактивності препарату, зменшення токсичних ефектів на організм пацієнта і досліджено цитотоксичність отриманих нанокон’югатів in vitro. Метою роботи є дослідження впливу нанокомпозитів на основі монодоменного магнетиту та гемцитабіну на життєздатність клітин гепатоцелюлярної карциноми печінки людини лінії HepG2 in vitro, визначення оптимального складу і концентрацій компонентів відповідного нанокон’югату. Об’єктом дослідження є поліфункціональний нанокомпозит на основі магнетиту та гемцитабіну. Предметом дослідження виступає структура, склад та біоактивність нанокомпозиту. Було використано методи досліджень: рентгенофазовий аналіз, ІЧ-Фур’є спектроскопія, вібраційна магнітометрія, спектрофотометрія, термогравіметричний аналіз, метод магнітної гранулометрії; для дослідження цитотоксичності отриманого нанокон’югату – методи роботи із культурами клітин. Виявлено особливості впливу складових та власне композитної системи на основі магнетиту, гемцитабіну і антитіл HepG2 на клітини гепатоцелюлярної карциноми, зокрема синергічний ефект компонентів магнітної рідини: магнетиту, цитостатику та антитіла. Значення отриманих результатів полягає у можливості досягнення цитотоксичного ефекту при лікуванні пухлинних захворювань за використання значно менших концентрацій хіміо- і імунотерапевтичних препаратів. Також отримані експериментальні дані свідчать про перспективність використання досліджених магнітних суспензій в методі адресної доставки та локальної терапії онкозахворювань.Документ Відкритий доступ Екстракція хітину з гриба гливи звичайної Pleurotus ostreatus при вирощуванні на субстратах з магнітними наночастинками(КПІ ім. Ігоря Сікорського, 2020-05) Радіонов, Олег Анатолійович; Горобець, Світлана ВасилівнаМагістерська дисертація: 86 с., 24 табл., 10 рис., 39 джерел. Збільшений в останні роки інтерес до хітину можна пояснити наступними причинами. Виявилося, що хітин надає клітинній стінці грибів особливі і дуже важливі властивості, а синтез цього полімеру є одним з контрольних механізмів, що визначають напрямок морфогенезу у грибів. Тому є актуальними дослідження, присвячені розробці способів отримання хітину з грибів, так як в даний час панцири крабів стали дефіцитною сировиною. Мета даної роботи – провести екстракцію хітин-глюканового комплексу грибів Pleurotus ostreatus, вирощених на субстратах з додаванням магнітної рідини різної концентрації. Об’єктом дослідження є біомаса гриба Pleurotus ostreatus, вирощеного на субстраті з додаванням магнітної рідини різної концентрації. Предметом дослідження є зміна кількості хітину в біомасі гриба Pleurotus ostreatus в залежності від концентрації магнітної рідини внесеної до субстрату. У роботі використано такі методи дослідження: морфологічний, фізико-хімічні, біоінформаційні. У ході досліджень було показано, що відсоток, екстрагованого з біомаси грибів гливи звичайної Pleurotus ostreatus, вирощеної на субстраті з додаванням магнітної рідини, збільшується майже втричі, порівняно з контрольним зразком.Документ Відкритий доступ Біотехнологія вирощування петрушки кучерявої Petroselinum crispum на ґрунтах з магнітними наночастинками(КПІ ім. Ігоря Сікорського, 2020-05) Кушнір, Єлизавета Євгенівна; Горобець, Світлана ВасилівнаДипломна робота містить 94 сторінки, 32 таблиці, 19 рисунків, перелік посилань з 111 найменувань. Сьогодні існує багато даних про наявність біогенних магнітних наночастинок (БМН) у еукаріоті прокаріот. Проте роль БМН, які є джерелом власних градієнтних магнітних полів, у рослин майже не вивчалася. При цьому, враховуючи єдиний генетичний механізм біомінералізації, дослідження БМН у рослин, вплив магнетиту на швидкість росту, морфологію рослин та на накопичення різних метаболітів, таких як флавоноїди, є перспективним і актуальними та можедати нові уявлення про роль цих частинок у функціонуванні рослинного організму. Мета даного дослідження–виявлення методами порівняльної геноміки рослин класу дводольні, які є потенційними продуцентами БМН, та порівняти морфологічні характеристики петрушки кучерявої Petroselinum crispum при вирощуванні на контрольних ґрунтах та на ґрунтах з магнітними наночастинками, дослілити вплив магнетиту на швидкість проростання насіння Petroselinum crispum, а також виділити та дослідити кількісний вміст флавоноїдів в експериментально отриманих рослинах. Предмет дослідження: морфологічні особливості рослин петрушки кучерявої Petroselinum crispum в залежності від концентрації внесеного до ґрунту магнетиту; швидкість проростання насіння в залежності від концентрацій магнетиту; концентрація флавоноїдів в експериментально отриманих рослинах. Об’єкт дослідження: геноми і протеоми магнітотаксисних бактерій (МТБ) Magnetospirillum gryphiswaldense MSR-1 і рослинних організмів класу дводольні; рослини та насіння петрушки кучерявої Petroselinum crispum, екстраговані розчини флавоноїдів. 6У роботі застосовано такі методи дослідження: методи порівняльної геноміки, методи морфологічного аналізу, метод екстракції флавоноїдів в 70% етанолі та метод спектрофотометрії. У роботі методами порівняльної геноміки було виявлено серед рослин класу дводольні потенційних продуцентів БМН. Проведено вирощування петрушки кучерявої Petroselinum crispumна контрольних та збагачених магнетитом ґрунтах та порівняно морфологію експериментально отриманих рослин. Досліджено вплив магнетиту на швидкість пророщування насіння Petroselinum crispum. Виділено та досліджено кількісний вміст флавоноїдівв рослинах петрушки кучерявої вирощених на контрольних ґрунтах та на ґрунтах з додаванням різних концентрацій магнетиту.Документ Відкритий доступ Вплив наночастинок магнетиту на синтез хітину в печериці Agaricus bisporus(КПІ ім. Ігоря Сікорського, 2020-05) Євжик, Любов Андріївна; Горобець, Світлана ВасилівнаМагістерська дисертація: 93 сторінки, 11 рисунків, 30 таблиць, 90 джерел. Хітин і хітозан – це природні біополімери, що містяться в оболонці ракоподібних, екзоскелетах комах і молюсків, а також в клітинних стінках грибів. Ці біополімери мають універсальне застосування в різних областях, таких як медицина, харчова промисловість і сільське господарство завдяки їх біосумісності, біодеградації та нетоксичності. Тому актуальним є пошук дешевої та доступної сировини для ефективної екстракції хітину. Метою роботи є отримання хітину з гриба печериці А. bisporus, вирощеної на субстраті без додавання магнітної рідини та на збагаченому магнетитом субстраті для дослідження різниці в кількості вмісту полісахариду. Об’єкт дослідження: геноми і протеоми грибів (відділів аско- та базидіоміцети), геном магнітотаксисної бактерії Magnetospirillum gryphiswaldense MSR-1, печериця А. bisporus, екстрагований хітин. Предмет дослідження: зміна характеристик БМН у зразках гриба печериці А. bisporus в залежності від концентрації внесеної до субстрату МР; зміна кількості магнітокерованої фази в печериці в залежності від концентрації внесеної до субстрату МР; зміна кількості хітину у зразках печериці А. bisporus в залежності від концентрації внесеної до субстрату магнітної рідини. У роботі використано такі методи дослідження: біоінформатичний, метод екстракції хітину, атомно-силова та магнітна силова мікроскопія, метод високоградієнтної магнітної сепарації. У ході досліджень було показано, що: гриби відділів аскоміцети, є потенційними продуцентами БМН; кількість магнітокерованої фази на основі гриба печериці А. bisporus, вирощеної на збагаченому магнітною рідиною субстраті, зростає на 37% в порівнянні з контролем; відсоток хітину вилученого з біомаси печериці А. bisporus, вирощеної на збагаченому магнетитом субстраті, зростає в 3 рази, порівняно з контролем.Документ Відкритий доступ Вплив наночастинок магнетиту на розвиток і морфологію томату звичайного Solanum lycopersicum(КПІ ім. Ігоря Сікорського, 2020-05) Теліженко, Валерія Сергіївна; Горобець, Оксана ЮріївнаМагістерська дисертація містить 98 сторінок, 36 таблиць, 11 рисунків, перелік посилань з 67 найменувань. Мета даного дослідження – дослідити вплив екзогенних та біогенних магнітних наночастинок на розвиток рослин томату S. lycopersicum. Об’єкт дослідження – геноми і протеоми магнітотаксисних бактерій (МТБ) Magnetospirillum gryphiswaldense MSR-1 і томату звичайного; рослини S. lycopersicum та окремі їх частини: насіння, корені, зелена біомаса, плоди. Предмет дослідження – генетичний механізм процесу біомінералізації БМН у рослин томату звичайного; процеси накопичення і розподілу екзогенних наночастинок магнетиту у Solanum lycopersicum та їх вплив на розвиток і урожайність рослин. Методи дослідження: методи порівняльної геноміки, методи морфологічного аналізу, фрактальний аналіз. У роботі було досліджено вплив магнітних наночастинок на схожість насіння і довжину коренів, біомасу і строки строки утворення квіток і плодів S. lycopersicum. Визначено оптимальну концентрацію для підвищення врожайності томату звичайного. Методами фрактального аналізу досліджено зміни у морфології коренів томату під впливом магнітних наночастинок.Документ Відкритий доступ Фізико-хімічні та деякі біологічні властивості позаклітинного лектину B. Subtilis IMB B-7724(КПІ ім. Ігоря Сікорського, 2019-12) Чурай, Ольга Ігорівна; Азнакаєв, Емір ГанєєвичМагістреська десертація: 91 сторінок, 12 рисунків, 25 таблиця, 77 джерел. Магістерська дисртація присвячена актуальній на сьогодні проблемі пошуку нових методів, які б дозволили підвищити ефективність лікування онкологічних хворих, забезпечили повноцінне функціонування імунної системи таких пацієнтів. Одним із шляхів вирішення цієї проблеми є застосування засобів імунотерапії, зокрема бактеріальних лектинів, які володіють не лише ад`ювантними властивостями, а й мають певну цитотоксичну по відношенню до пухлинних клітин дію. Метою роботи є визначення ряду біологічних характеристик позаклітинного метаболіту B. subtilis ІМВ B-7724та оцінка фізико-хімічних властивостей отриманого з культуральної рідини мікроорганізма лектину. Об’єкт дослідження – лектин бактеріального походження; пухлинні клітини. Предмет дослідження – гемаглютинуюча та цитотоксична активність зразків культуральної рідини та виділеного з неї лектину, молекулярна маса, однорідність, стабільність речовини. В роботі було використано такі методи дослідження: мікробіологічні, культуральні, фізико-хімічні та статистичні методи. У ході дослідження вперше було показано, що речовина, яка була виділена з культуральної рідини B. subtilis ІМВ B-7724 володіє гемаглютинуючою та цитотоксичною активністю, ступінь вираженості якої залежить від умов аерації культурального середовища. Визначено молекулярну масу речовини та показано молекулярний склад речовини. Одержаний лектин є термостабільним в діапазоні температур від 20 до 90° С і стійким до зміни рН середовища в діапазоні від 6 до 9.Документ Відкритий доступ Біотехнологія створення системи адресної доставки лікарських засобів на основі бактерій Escherichia coli Nissle 1917 для терапії раку(КПІ ім. Ігоря Сікорського, 2019-12) Міленко, Юлія Вікторівна; Горобець, Світлана ВасилівнаМагістерська дисертація містить 110 сторінок, 34 таблиці, 21 рисунок, перелік посилань з 76 найменувань. Мета даного дослідження – створити систему адресної доставки лікарських засобів для терапії раку на основі пробіотичної бактерії – продуцента БМН Escherichia coli Nissle 1917. Об’єкт дослідження – магнітні властивості бактерій-продуцентів БМН Escherichia coli Nissle 1917 та їх практичне застосування для адресної доставки протиракових лікарських засобів. Предмет дослідження – процес біомінералізації біогенних магнітних наночастинок (БМН) у Escherichia coli Nissle 1917 та можливість посилення магнітних властивостей E. coli Nissle 1917, як продуцента БМН, за допомогою використання хелату заліза та магнітного поля, застосування цього штаму для створення магніточутливої системи адресної доставки лікарських засобів для терапії раку. Методи дослідження: біоінформаційний аналіз, атомно-силова та магнітно-силова мікроскопія, аналіз із застосуванням системи двох постійних магнітів, аналіз та візуалізація даних у програмі «Gwyddion». У роботі було проведено біоінформаційний аналіз протеомів бактерій, що накопичуються у пухлинах, на предмет здатності до утворення БМН. Визначено продуцентів БМН серед пробіотичних бактерій і досліджено накопичення БМН у штаму E.coli Nissle 1917 методами атомно-силової та магнітно-силової мікроскопії. Досліджено вплив хелату заліза та магнітного поля на процеси біомінералізації та росту у E.coli Nissle 1917. Синтезовано ліпосоми та прикріплено їх до бактеріальних клітин у якості мікроконтейнерів для лікарських засобів.Документ Відкритий доступ Біотехнологія отримання магнітокерованого біосорбенту з активного мулу(КПІ ім. Ігоря Сікорського, 2020-05) Пономаренко, Дарина Сергіївна; Горобець, Світлана ВасилівнаМагістерська дисертація: 84 сторінки, 2 рисунки, 37 таблиць, 81 джерела. Біосорбція є одним з універсальних методів очистки води від іонів важких металів, що є економічно вигідною та екологічною альтернативою іншим промисловим методам. Однією з переваг даного методу є можливість застосування низьковартісних сорбентів, таких, як відходи біосами. Тому актуальним є пошук дешевого та простого для вилучення біологічного сорбенту, яким може стати активний мул водоочисних споруд. Метою роботи є визначення оптимального режиму отримання магнітокерованої фракції активного мулу для виготовлення магнітокерованого сорбенту на його основі. Об’єкти дослідження: геноми і протеоми мікроорганізмів активного мулу, присутніх в зразку, геном магнітотаксисної бактерії (МТБ) Magnetospirillum gryphiswaldense MSR-1, біомаса активного мулу «Чернігівводоканалу», високоградієнтна магнітна сепарація, високоградієнтні феромагнітні насадки. Предмети дослідження: ефективність вилучення магнітокерованої фракції активного мулу методом високоградієнтної магнітної сепарації. В роботі використано такі методи дослідження: біоінформатичний, метод високоградієнтної магнітної сепарації. В ході дослідження було показано, що мікроорганізми в складі активного мулу є потенційними продуцентами БМН; визначено, що найбільш ефективним для вилучення магнітокерованої фази активного мулу є режим швидкості 1,5 мл/хв та феромагнітна насадка у вигляді сітки – ефективність склала близько 20%.Документ Відкритий доступ Створення хмарного біоінформатичного програмного забезпечення для аналізу даних експресії генів людини(КПІ ім. Ігоря Сікорського, 2020-05) Шинкаренко, Олександр Андрійович; Шевгалішин, Роман ЛьвовичТранскриптоміка — це сукупність методів, що займаються аналізом даних експресії генів. Більшість ранніх транскриптомних методів цікавилася широкою групою генів. На додаток до проведення дослідницьких аналізів, заснованих на нормалізації рівня експресії, було спрямовано чимало зусиль на оптимізацію статистичних тестів, що вирішують, чи є різниця в експресії вибраного гену між двома (або більше) умовами (фенотипами). Такий аналіз називається аналізом диференціальної експресії (Differential Gene Expression analysis, DGE). Двома основними завданнями всіх інструментів DGE є: 1. Оцінити величину диференціальної експресії між двома або більше умовами на основі підрахунку читання від повторених зразків, тобто обчислити зміну кількості зчитувань у ході секвенування. 2. Оцінити статистичну значущість різниці. Оглянувши типові види візуалізацій, ми можемо встановити, що існуючі методи: складні в розумінні та вимагають значного поглиблення для повного розуміння. Зазвичай не дозволяють функціонально оцінити набори генів на генному рівні. Я створив нову візуалізацію, яка дозволяє це зробити. Крім того, було створено програмне забезпечення для відображення цієї та інших відомих візуалізацій.Документ Відкритий доступ Вплив сорбції пробiотичних культур на високодисперсному кремнеземi на функціональні властивості заквашувального препарату(КПІ ім. Ігоря Сікорського, 2020-12) Киселюк, Дарія Олегівна; Маринченко, Лоліта ВікторівнаМагістерська дисертація містить 100 сторінок, 29 таблиць, 20 рисунків, перелік посилань з 74 найменувань. Мета дослідження – дослідити можливості створення заквашувального препарату на основі іммобілізації пробіотичних культур на зразках сухого високодисперсного кремнезему та гідрогелі метилкремнієвої кислоти. Об’єкт дослідження – пробіотичні мікроорганізми: Bifidobacterium longum, Streptococcus thermophilus, Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus; високодисперсний кремнезем. Предмет дослідження – закономірності іммобілізованої на кремнеземовій матриці заквашувальної культури (захисні, біотехнологічні та реологічні характеристики, вплив магнітного поля). Методи дослідження: мікробіологічні, реологічні, біотехнологічні, статистичні, фрактальний аналіз мікрозображень. У роботі було досліджено виживаність B. longum та S. thermophilus, іммобілізованих на високодисперсному кремнеземі та ліофільно висушених, виживаність у модельованих умовах верхніх відділів шлунково-кишкового тракту; біотехнологічні та реологічні властивості кисломолочного продукту, сквашеного іммобілізованою культурою S. thermophilus; вплив магнітного поля на взаємодію іммобілізованих та неіммобілізованих пробіотичних штамів S. thermophilus та L. bulgaricus з кремнієвою пластиною шляхом проведення фрактального аналізу отриманих мікрозображень. Визначено придатність іммобілізованих пробіотичних штамів до використання у харчовій промисловості як заквашувальних препаратів.Документ Відкритий доступ Вплив магнітного поля і похідного тіосемікарбазонів на клітини К562 мієлоїдного лейкозу людини(КПІ ім. Ігоря Сікорського, 2020-12) Робота, Олександра Володимирівна; Горобець, Оксана ЮріївнаМагістерська дисертація містить 84 сторінок, 27 таблиць, 14 рисунків, перелік посилань з 85 найменувань. Мета даного дослідження – комплексне вивчення впливу магнітного поля та препарату Ізатізон на клітини К562 хронічного мієлоїдного лейкозу. Об’єкт дослідження – клітини лінії К562 хронічного мієлоїдного лейкозу людини. Предмет дослідження – вплив магнітного поля та препарату Ізатізон на клітини К562 хронічного мієлоїдного лейкозу. Методи дослідження: кількісний підрахунок клітин, МТТ-тест, Вестерн-блот. У роботі було досліджено вплив магнітного поля та препарату Ізатізон на клітини К562. Визначено вплив магнітного поля на проліферацію клітин. Методом Вестерн-блоту було підтверджено здатність магнітного поля пришвидшувати проліферацію при короткотривалому впливі, та здатність препарату Ізатізон викликати апоптоз в клітинах лейкозу. Також було проведено МТТ-тест виживаності клітин, що інкубувалися з препаратом в магнітному полі. Нами було перевірено клітини К562 на наявність природних магнітокерованих властивостей.Документ Відкритий доступ Визначення впливу лазерного випромінювання для фотодисоції карбоксигемоглобіну при курінні(КПІ ім. Ігоря Сікорського, 2020-12) Циктор, Роман Михайлович; Горго, Юрій ПавловичДипломна робота: 97 стор., 57 рис., 13 табл., 65 посилань Актуальним питанням охорони здоров'я та сучасної медицини можна зазначити вплив на ступінь оксигенації крові і здоров’я людини вживання тютюнових виробів через вдихання продуктів куріння. Це можливо шляхом визначення вмісту карбоксигемоглобіну в крові та застосування методів зниження або мінімізації наслідків куріння. Тому розробка методів та засобів неінвазивного визначення вмісту карбоксигемоглобіну в крові та детоксикації при отруєнні курців і не курців є актуальною задачею. Метою даної роботи було дослідження та аналіз динаміки впливу лазерного випромінювання на комплекси гемоглобіну –карбоксигемоглобіну, та визначення дії лазерного випромінення для спричинення фотодисоціації карбоксигемоглобіну в процесі куріння. До групи ризику, крім курців, були віднесені пасивні курці, в яких також спостерігається підвищений вміст карбоксигемоглобіну. Досліджувались процеси, які мають місце при взаємодії лазерного випромінювання різних хвильових діапазонів із комплексами гемоглобіну, та їх подальшою дисоціацією. Були визначені зміни відносної концентрації оксигемоглобіну у крові, периферичних тканинах кінцівок та м’яких тканинах людини, які були доступними для опромінювання низькоенергетичним лазером. В роботі також визначено ступінь впливу низькоенергетичного лазерного випромінювання різних хвильових діапазонів для фотодисоції карбоксигемоглобіну при курінні.Документ Відкритий доступ Вплив експресії генів десатураз ціанобактерій у трансгенного тютюну на стійкість рослини до ультрафіолетового випромінювання(КПІ ім. Ігоря Сікорського, 2020-12) Золочевський, Максим Юрійович; Дем’яненко, Ірина ВолодимирівнаМагістерська дисертація: 89 с., 27 Таблиця, 17 рис., 75 джерел. З підвищенням глобальних обсягів промислових викидів, проблема виснаження озонового шару не втрачає актуальності. Ослаблення озонового шару посилює потік сонячної радіації на землю і викликає у живих організмів негативні зміни на клітинному і молекулярному рівнях. Це робить дослідження, спрямовані на підвищення адаптивної здатності рослин до надлишкового опромінювання світлом УФ-спектру, досить перспективними. Насамперед, адаптаційні можливості та захисні властивості рослинних клітин залежать від складу їх мембранних ліпідів, та фактору переходу жирних кислот (ЖК) з фази гелю у рідкокристалічну. Мета даної роботи – дослідити вплив експресії генів desC та desA, що кодують ацил-ліпідну десатуразу, на стійкість трансгенної рослини Nicotiana tabacum до впливу УФ-випромінювання. Об’єктами дослідження є ген desC, що кодує Δ9-ацил-ліпідну десатуразу ціанобактерії Synechococcus vulcanus та ген desA, кодуючий Δ12-ацил-ліпідну десатуразу ціанобактерії Synechocystis sp. PCC 6803, перенесені у тютюн за допомогою Agrobacterium tumefaciens-опосередкованої трансформації. Предмет дослідження – вплив генів десатураз ЖК ціанобактерій на адаптивну здатність рослини Nicotiana tabacum до надмірного УВ. За допомогою статистичної обробки отриманих у ході дослідження експерементальних даних та їх порівняння з контрольними зразками, було доведено: рівень пошкоджень мембран у рослин, що експресують додаткові гени десатураз–нижчий, ніж у контрольних рослин.Документ Відкритий доступ Удосконалення технології бацитрацину(КПІ ім. Ігоря Сікорського, 2020-12) Чикиринда, Владислав Петрович; Маринченко, Лоліта ВікторівнаМагістерська дисертація викладена на117сторінках друкованого тексту. Робота складається зі вступу, п’яти розділів, висновків, списку використаних джерел та містить8рисунків, 32 таблиці, 2 креслення та 1 додаток. Магістерська дисертація присвячена вдосконаленню технології виробництва антибіотику бацитрацину для використання його у складі комбінованого препарату мазі, що застосовується при лікуванні та профілактиці інфекційних запалень. Тема дисертації є актуальною, оскільки підвищення темпів росту атибіотикорезистентності бактерій вимагає пошуку ефективних способів лікування, таких як використання комбінованих лікарських засобів. В проєкті наведено обгрунтування вибору технологічної схеми виробництва комбінованої мазі бацитрацинута неоміцину, з повним циклом виробництва бацитрацину цинку, на основі аналізу літературних даних. Вдосконалено апаратурну схему виробництва, завдяки оптимізації стадії виділення антибіотичного препарату.