Порівняльний аналіз диференційної експресії генів плаценти між триместрами фізіологічної вагітності
Вантажиться...
Дата
2025
Науковий керівник
Назва журналу
Номер ISSN
Назва тому
Видавець
КПІ ім. Ігоря Сікорського
Анотація
Дипломна робота містить 130 сторінок, 1 таблиця, 15 рисунків, 183 джерела. Мета роботи: здійснити порівняльний та розвідувальний аналіз диференційної експресії генів плаценти між триместрами фізіологічної вагітності для виявлення молекулярних механізмів розвитку плаценти та потенційних
біомаркерів прееклампсії. Об’єкт дослідження: інтегрований масив мікрочіпових даних експресії генів плаценти людини (77 зразків із репозитарію GEO), що охоплює I, II та III триместри фізіологічної вагітності. Предмет дослідження: диференційна експресія генів у плаценті людини між першим-другим і другим-третім триместрами фізіологічної вагітності. Матеріали і методи дослідження: попередньо оброблені дані експресії генів плаценти, отримані за технологією мікрочіпів, R-пакети для візуалізації (ggplot2, smoothScatter тощо) та бібліотеки для аналізу збагачення шляхів (ReactomePA, KEGGREST). Результати роботи: У процесі дослідження фізіологічної вагітності виявлено 323 диференційно експресовані гени між I та II триместрами –та 617 генів між II та III триместрами. Візуалізовано ключові сигнальні шляхи, в яких беруть участь потенційні біомаркери: PAEP, ALPP та CRH, що відображає їхню роль у регуляції проліферації та диференціації трофобластів (через PI3K–Akt та TGF-B) та стимуляції ангіогенезу й адаптації плаценти до гіпоксії (через HIF-1 та VEGF). Наукова новизна: в результаті багаторівневого біоінформатичного функціонального аналізу було підтверджено ідентифікацію 20 генів із найбільш значущими змінами експресії між першим і другим та другим і третім триместрами фізіологічної вагітності та візуалізовано ключові сигнальні шляхи, такі як TGF beta, Wnt, PI3K-Akt, JAK, STAT, в яких ці потенційні біомаркери прееклампсії беруть участь; поглиблено уявлення про молекулярні механізми розвитку плаценти для виявлення потенційних біомаркерів прееклампсії.
Опис
Ключові слова
плацента, диференційна експресія генів, мікрочіпи, вулканічний графік, MA-графік, прееклампсія, placenta, differential gene expression, microarrays, volcano plot, MA plot, preeclampsia
Бібліографічний опис
Левченко, С. О. Порівняльний аналіз диференційної експресії генів плаценти між триместрами фізіологічної вагітності : дипломна робота … бакалавра : 162 Біотехнології та біоінженерія / Левченко Станіслав Олександрович. — Київ, 2024. — 130 с.