Класифікування пробіотиків-продуцентів біогенних магнітних наночастинок у «зеленому синтезі»
Вантажиться...
Дата
2025
Автори
Науковий керівник
Назва журналу
Номер ISSN
Назва тому
Видавець
КПІ ім. Ігоря Сікорського
Анотація
Дипломна робота містить: 74 сторінки, 6 таблиць, 7 рисунків, перелік посилань із 87 найменувань, 7 додатків. Деякі види та штами пробіотиків здатні синтезувати біогенні наночастинки, що мають широке застосування у різних галузях. Біоінформатичний пошук гомологів основних білків біомінералізації магнітотаксисних бактерій (mamA, mamB, mamM, mamE, mamO) дозволяє проводити швидкий пошук імовірних продуцентів, із визначенням локалізації та типу внутрішньої будови наночастинок. Об’єкти дослідження: основні білки біомінералізації Magnetospirillum gryphiswaldense MSR-1 (mamA, mamB, mamM, mamE, mamO) та протеоми 199 штамів 31 виду пробіотиків. Предмет дослідження: проблема взаємозв’язку локалізації (внутрішньоклітинна, зовнішньоклітинна) та типу внутрішньої будови біогенних наночастинок (кристалічна, аморфна) з наявністю гомологів основних білків біомінералізації БМН Magnetospirillum gryphiswaldense MSR-1 (mamA, mamB, mamM, mamE, mamO) у пробіотиків. Мета роботи - розробка моделі для класифікації пробіотиків за локалізацією та типом внутрішньої будови біогенних наночастинок на основі даних про наявність в їх протеомах гомологів основних білків біомінералізації БМН Magnetospirillum gryphiswaldense MSR-1(mamA, mamB, mamM, mamE, mamO) Матеріали дослідження: протеоми 199 штамів 31 виду пробіотиків; амінокислотні послідовності основних білків біомінералізації (mamA, mamB, mamM, mamE, mamO) магнітотаксисної бактерії Magnetospirillum gryphiswaldense MSR-1. Методи дослідження: попарне вирівнювання амінокислотних послідовностей у програмі «BLAST» ; методи машинного навчання (дерево рішень та випадковий ліс).У роботі біоінформатичними методами встановлено, що переважна більшість пробіотиків утворює внутрішньоклітинні наночастинки. За типом внутрішньої будови переважають кристалічні, хоча наявні і аморфні наночастинки. Показано, що у різних пробіотиків одного виду можуть утворюватися різні за локалізацією та типом внутрішньої будови біогенні наночастинки, що додатково підтверджує необхідність точного визначення штаму мікроорганізму, що володіють механізмом біомінералізації для їх використання у зеленому синтезі біогенних наночастинок.
Опис
Ключові слова
біомінералізація, біогенні магнітні наночастинки, штучні магнітні наночастинки, пробіотики, основні білки біомінералізації, класифікація, машинне навчання, biomineralization, biogenic magnetic nanoparticles, artificial magnetic nanoparticles, probiotics, key biomineralization proteins, classification, machine learning
Бібліографічний опис
Гуменюк, А. С. Класифікування пробіотиків-продуцентів біогенних магнітних наночастинок у «зеленому синтезі» : дипломна робота ... бакалавра : 162 Біотехнології та біоінженерія / Гуменюк Анастасія Сергіївна. — Київ, 2025. — 196 с.